2002 թվականի մարտին նշանակվել է Ռուսաստանի Մ-16 պատանեկան հավաքականի գլխավոր մարզիչ եւ երեք անգամ հաղթել է միջազգային մրցաշարերում:
2002 թվականի օգոստոսին նշանակվել է Ռուսաստանի երիտասարդական հավաքականի գլխավոր մարզիչ (Մ-21): Նորամուտը տնային ընկերական խաղն էր օգոստոսի 21-ին հասակակիցների Շվեդիայում (3:1)[1].
2003 թվականի մարտին նշանակվել է Մոսկվայի «Սպարտակ» ֆուտբոլային ակումբի մարզական տնօրեն:
2003թ. մարտից նշանակվել է Մոսկվայի "Սպարտակ" ֆուտբոլային ակումբի մարզական տնօրեն:
2003թ. հունիսին Օլեգ Ռոմանցևի հեռանալուց հետո նշանակվել է «Սպարտակի» գլխավոր մարզիչ՝ շարունակելով մարզել երիտասարդական հավաքականը[2]։Թիմը 14-րդ տուրում 14-րդ տեղում է ։ Ակումբը լքել է նույն տարվա սեպտեմբերին ՝ երեք ամսից էլ քիչ գլխավոր մարզիչ աշխատելով [3] (Նրա ղեկավարությամբ թիմն անցկացրել է 10 խաղ ՝ 5 հաղթանակ և 5 պարտություն), կենտրոնանալով երիտասարդական հավաքականի հետ աշխատանքի վրա, ընդ որում, Չերնիշովի հետ թիմը լքել է նաև նրա ամբողջ շտաբը, ներառյալ բժիշկներն ու վարչական աշխատողները[4]։ «Սպարտակն» ավարտեց Վլադիմիր Ֆեդոտովի գլխավորությամբ և գրավեց 10-րդ տեղը:
2005 թվականի նոյեմբերի 21-ին ՌՖՄ-ն և Չերնիշովը համաձայնության եկան աշխատանքային պայմանագիրը դադարեցնելու մասին, որը կնքվել էր 2004 թվականի ապրիլի 1-ին և հաշվարկված էր մինչև 2006 թվականի հուլիսի 31-ը։[5]։ Եվրոպայի երիտասարդական առաջնության ընտրական մրցաշարում Չերնիշովի թիմը, մեկնարկելով 4 հաղթանակներով, արդյունքում դուրս չի եկել խմբից՝ զբաղեցնելով 2-րդ տեղը[3]։ Հաջորդ ընտրական փուլում խմբում կրկին 2-րդ տեղն է, որին հաջորդել է դանիացիներից կրած պարտությունը անցումային հանդիպումներում (0:1, 1:3), ընդ որում, առաջին թիմի ուժեղացված թիմի կազմում պատասխան խաղում հինգ ռուսաստանցիներ ստացել են կարմիր քարտեր և հեռացվել խաղադաշտից[5]։ Չերնիշևի երիտասարդական հավաքականի հետ աշխատանքի ընթացքում թիմը երկու անգամ հայտնվել է թոփ-16-ում։17 խաղացողներ հետո առաջին հավաքականում հանդես եկան 2008 թվականի Եվրոպայի առաջնությունում, որտեղ գրավեցին 3-րդ տեղը։
