ԴՆԹ լիգազ

Լիգազ I, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ
Բնորոշիչներ
Սիմվոլ	LIG1
Entrez	3978
HUGO	6598
OMIM	126391
RefSeq	NM_000234
UniProt	P18858
Այլ տվյալներ
Լոկուս	Քրոմ. 19 {{{Arm}}}{{{Band}}}{{{LocusSupplementaryData}}}

Որոնում
PubMed Central	հոդվածներ
PubMed	հոդվածներ
NCBI	հոդվածներ

ԴՆԹ լիգազ
	Քրոմոսոմալ վնասվածքը կարգավորող ԴՆԹ լիգազ
Տեսակ	ֆերմենտների խումբ կամ դաս
Ենթադաս	Լիգազներ և DNA-modifying enzyme?
Բնորոշիչներ
ՖՀ համար	6.5.1.1
CAS համար	9015-85-4
Տվյալներ
IntEnz	IntEnz կայքում
BRENDA	BRENDA կայքում
ExPASy	NiceZyme կայքում
KEGG	KEGG կայքում
MetaCyc	մետաբոլիզմ
PRIAM	PRIAM կայքում
Protein Data Bank	RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum
Գենի օնտոլոգիա	AmiGO / EGO
Որոնում
PubMed Central	հոդվածներ
PubMed	հոդվածներ
NCBI	հոդվածներ

ԴՆԹ լիգազ (ՖՀ 6.5.1.1), ֆերմենտ, լիգազ, որը կատալիզում է ԴՆԹ-ի շղթաների միացումը՝ ֆոսֆոդիէսթերային կապերի առաջացմամբ^[1]։

Լիգազ III, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ
Բնորոշիչներ
Սիմվոլ	LIG3
Entrez	3980
HUGO	6600
OMIM	600940
RefSeq	NM_002311
UniProt	P49916
Այլ տվյալներ
Լոկուս	Քրոմ. 17 q11.2-q12

Լիգազ IV, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ
Բնորոշիչներ
Սիմվոլ	LIG4
Entrez	3981
HUGO	6601
OMIM	601837
RefSeq	NM_002312
UniProt	P49917
Այլ տվյալներ
Լոկուս	Քրոմ. 13 q33-q34

ԴՆԹ լիգազը օգտագործվում է ԴՆԹ ռեպարացիայի և ռեպլիկացիայի ժամանակ։ Բացի այդ՝ այն օգտագործվում է մոլեկուլային կենսաբանության մեջ, ռեկոմբինանտ ԴՆԹ-ի ստացման համար։

Առաջին անգամ ԴՆԹ լիգազ ստացվել և նկարագրվել է 1967 թվականին^[2]։

Մեխանիզմ խմբագրել

ԴՆԹ լիգազի ազդման մեխանիզմն իր մեջ է ներառում երկու ֆոսֆոդիէսթերային կապերի առաջացումը նուկլեոտիդներից մեկի 3' հիդրօքսիլի և մյուսի 5' ֆոսֆատի միջև։ ԱԵՖ-ն անհրածեշտ է հետևյալ երեք պրոցեսներում

ֆերմենտի ակտիվ կենտրոնում լիզինի մնացորդի ադենիլացում
ԱՄՖ-ի փոխանցում 5' ֆոսֆատի մոտ
ֆոսֆոդիէսթերային կապի առաջացում^[3]

Տեսակներ խմբագրել

E. coli ԴՆԹ լիգազ խմբագրել

E. coli ԴՆԹ լիգազը կոդավորվում է lig գենով։ Շատ պրոկարիոտների մոտ ԴՆԹ լիգազը ստանում է էներգիա NAD-ից^[4]։

T4 ԴՆԹ լիգազ խմբագրել

Բակտերիոֆագ T4-ից ստացված ԴՆԹ լիգազը հաճախ օգտագործվում է կենսաբանական լաբորատորիաներում^[5]^[6]։

Կաթնասունների լիգազներ խմբագրել

Կաթնասունների մոտ կան հիմնականում չորս տիպի լիգազներ^[4]՝LIG1, LIG2, LIG3, LIG4։

Տես նաև խմբագրել

ԴՆԹ

Ծանոթագրություններ խմբագրել

↑ Pascal JM, O'Brien PJ, Tomkinson AE, Ellenberger T (2004 թ․ նոյեմբեր). «Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA». Nature. 432 (7016): 473–8. doi:10.1038/nature03082. PMID 15565146.{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link)
↑ Weiss B, Richardson CC (1967 թ․ ապրիլ). «Enzymatic breakage and joining of deoxyribonucleic acid, I. Repair of single-strand breaks in DNA by an enzyme system from Escherichia coli infected with T4 bacteriophage». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 57 (4): 1021–8. doi:10.1073/pnas.57.4.1021. PMC 224649. PMID 5340583.
↑ Lehman IR (1974 թ․ նոյեմբեր). «DNA ligase: structure, mechanism, and function». Science. 186 (4166): 790–7. doi:10.1126/science.186.4166.790. PMID 4377758.
↑ ^4,0 ^4,1 Foster JB, Slonczewski J (2010). Microbiology: An Evolving Science (Second ed.). New York: W. W. Norton & Company. ISBN 0-393-93447-0.
↑ «Ligases» (PDF). Enzyme Resources Guide. Promega Corporation. էջեր 8–14.
↑ Wilson RH, Morton SK, Deiderick H, Gerth ML, Paul HA, Gerber I, Patel A, Ellington AD, Hunicke-Smith SP, Patrick WM (2013 թ․ հուլիս). «Engineered DNA ligases with improved activities in vitro». Protein Eng. Des. Sel. 26 (7): 471–8. doi:10.1093/protein/gzt024. PMID 23754529.{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link)

Արտաքին հղումներ խմբագրել

Վիքիպահեստն ունի նյութեր, որոնք վերաբերում են «ԴՆԹ լիգազ» հոդվածին։

[pmid15565146-1] Pascal JM, O'Brien PJ, Tomkinson AE, Ellenberger T (2004 թ․ նոյեմբեր). «Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA». Nature. 432 (7016): 473–8. doi:10.1038/nature03082. PMID 15565146.{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link)

[WeissRichardson1967-2] Weiss B, Richardson CC (1967 թ․ ապրիլ). «Enzymatic breakage and joining of deoxyribonucleic acid, I. Repair of single-strand breaks in DNA by an enzyme system from Escherichia coli infected with T4 bacteriophage». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 57 (4): 1021–8. doi:10.1073/pnas.57.4.1021. PMC 224649. PMID 5340583.

[pmid4377758-3] Lehman IR (1974 թ․ նոյեմբեր). «DNA ligase: structure, mechanism, and function». Science. 186 (4166): 790–7. doi:10.1126/science.186.4166.790. PMID 4377758.

[foster-4] 4,0 ^4,1 Foster JB, Slonczewski J (2010). Microbiology: An Evolving Science (Second ed.). New York: W. W. Norton & Company. ISBN 0-393-93447-0.

[url_www.promega.com-5] «Ligases» (PDF). Enzyme Resources Guide. Promega Corporation. էջեր 8–14.

[pmid23754529-6] Wilson RH, Morton SK, Deiderick H, Gerth ML, Paul HA, Gerber I, Patel A, Ellington AD, Hunicke-Smith SP, Patrick WM (2013 թ․ հուլիս). «Engineered DNA ligases with improved activities in vitro». Protein Eng. Des. Sel. 26 (7): 471–8. doi:10.1093/protein/gzt024. PMID 23754529.{{cite journal}}: CS1 սպաս․ բազմաթիվ անուններ: authors list (link)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]