[[Պատկեր:Paramecium caudatum conjugation.ogv|մինի|[[Конъюгация у инфузорий|Конъюгация]] инфузорий-туфелек]]
У инфузории-туфельки есть бесполое размножение, в то же время у неё присутствует половой процесс, который не приводит к размножению. Бесполое размножение — поперечное деление в активном состоянии. Оно сопровождается процессами регенерации. Например, одна из особей заново образует клеточный рот с околоротовой цилиатурой, каждая достраивает недостающую сократительную вакуоль, происходит размножение базальных телец и образование новых ресничек и т. п.
Половой процесс, как и у других инфузорий, происходит в форме [[Конъюгация у инфузорий|конъюгации]]{{sfn|Полянский Ю. И.|1987|с=99}}. Туфельки, относящиеся к разным [[Клонирование (биология)|клонам]], временно «склеиваются» ротовыми сторонами, и между клетками образуется цитоплазматический мостик. Затем макронуклеусы конъюгирующих инфузорий разрушаются, а микронуклеусы делятся путём [[мейоз]]а. Из образовавшихся четырёх гаплоидных ядер три погибают, а оставшаяся делится [[митоз]]ом{{sfn|Полянский Ю. И.|1987|с=99}}. В каждой инфузории теперь есть два гаплоидных [[пронуклеус]]а — один из них женский (стационарный), а другой — мужской (мигрирующий). Инфузории обмениваются мужскими пронуклеусами, а женские остаются в «своей» клетке. Затем в каждой инфузории «свой» женский и «чужой» мужской пронуклеусы сливаются, образуя диплоидное ядро — [[синкарион]]. При делении синкариона образуется два ядра. Одно из них становится диплоидным микронуклеусом, а второе превращается в полиплоидный макронуклеус. Реально этот процесс происходит сложнее и сопровождается специальными постконъюгационными делениями.
