[[Պատկեր:MUG_Hospital_Bldg_1.jpg|ձախից|մինի|250x250փքս|Գդանսկի բժշկական համալսարանի պատմական շենքը]]
Համալսարանն ստեղծվել է 1454 թվականին, երբ այդ ժամանակվա ԴանցիգըԴանցիգում հիմնադրեցհիմնադրվեկ վիրաբուժներիէ արտադրամասըվիրաբույժների ցեխ, ապա՝ ապա բժշկական ամբիոն Ակադեմիական գիմնազիայում բժշկական ամբիոնը (Atheneum Gedanense)։
1935 թվականին ԱզատԴանցիգ քաղաքազատ քաղաքի Դանցիգի սենատը որոշեցորոշել է ստեղծել գործնական պարապմունքների բժշկական ակադեմիա (Die Staatliche Akademie für Praktische Medizin zu Danzig)։ 1945 թվականից հետո այն վերակառուցվելվերակազմավորվել է որպես Բժշկական ակադեմիա: 1950 թվականից մինչև 2009 թվականի մայիսի 19-ն այն գործել է որպես Գդանսկի Բժշկականբժշկական ակադեմիա։