Լին հայտնի էր որպես [[ագնոստիցիզմ|ագնոստիկ]]<ref>{{Cite news|title=Days of reflection for the man who defined Singapore: A transcript of Minister Mentor Lee Kuan Yew's interview with The New York Times|url=http://www.todayonline.com/Print/Commentary/EDC100913-0000046/Days-of-reflection-for-the-man-who-defined-Singapore|archiveurl=http://www.webcitation.org/5siZa8Szv|archivedate=13 September 2010|newspaper=[[Today (Singapore newspaper)|Today]]|location=Singapore|date=13 September 2010|pages=14–17}}</ref> մի քանի առիթներով, մասնավորապես, 1983 թվականին Գո Քեն Սվիին տված հարցազրույցում Լին հայտնի է դարձել որպես ագնոստիկ։<ref>Chan Eng Cheng (4 February 1983). [http://newspapers.nl.sg/Digitised/Article/straitstimes19830204-1.2.6.aspx An Agnostic speaks]. ''The Straits Times'' (Singapore).</ref> Լին անձամբ հայտարարել է իր ագնոստիցիզմի մասին ''[[TheՆյու NewՅորք York TimesԹայմս]]'' in 2010 թվականին Նյու Յորք թայմսին տված իր հարցազրույցի ընթացքում, սակայն նա ճշտեց, որ պատանեկության տարիներին նա զբաղվել է Չինական ժողովրդական կրոնով։ 1997 թվականին, հոր մահից հետո, Լին դադարեցրեց զբաղվել չինական ժողովրդական կրոնով։<ref name="SethMydans">[http://www.pmo.gov.sg/content/pmosite/mediacentre/speechesninterviews/ministermentor/2010/September/transcript_of_ministermentorleekuanyewsinterviewwithsethmydansof.html Transcript of Minister Mentor Lee Kuan Yew's interview with Seth Mydans of''New York Times'' & IHT on 1 September 2010.], Prime Minister's Office of Singapore. Retrieved 31 January 2014.</ref> Նա ամրապնդեց իր կրոնական հայացքները, հայտարարելով, "Ես չէի ասի, որ ես աթեիստ եմ, ես ոչ կարող եմ մերժել, ոչ ընդունել, որ կա աստված"։<ref>[http://www.thestar.com.my/News/Nation/2013/08/06/lee-kuan-yew.aspx/ "Lee Kuan Yew on death: I want mine quickly, painlessly"]. ''The Star'' (Kuala Lumpur), 6 August 2013.</ref> 2009 թվականին, Լի Կուան Յուն իրեն ներկայացել է որպես Բուդդիստ/Տաոիստ համայնքի անդամ, ''National Geographic Magazine''-ին տված հարցազրույցում.<ref>[http://www.ibtimes.co.in/lee-kuan-yew-6-interesting-facts-about-singapores-founding-father-memorable-quotes-626971 Lee Kuan Yew: 6 Interesting Facts about Singapore's Founding Father; Memorable Quotes]</ref><ref>[http://www.news.gov.sg/public/sgpc/en/media_releases/agencies/pmo/transcript/T-20091228-1.html TRANSCRIPT OF MINISTER MENTOR LEE KUAN YEW'S INTERVIEW WITH MARK JACOBSON FROM NATIONAL GEOGRAPHIC ON 6 JULY 2009 (FOR NATIONAL GEOGRAPHIC MAGAZINE JAN 2010 EDITION)], SGPressCentre; retrieved 1 February 2014.</ref> Նրա երկու կրտսեր եղբայրները՝ Ֆրեդի Լին<ref>[http://news.asiaone.com/News/Latest%2BNews/Singapore/Story/A1Story20120630-356315.html Lee Kuan Yew bids farewell to brother], AsiaOne.com, 30 June 2012; retrieved 1 February 2014.</ref> և Լի Սուան Յուն, համապատասխանաբար Անգլիկան և Մեթոդիստ եկեղեցիների անդամ էին։<ref name="SethMydans"/>
