Նյութական կետի հասկացության կիրառման սահմանափակումներն ակնհայտ են հետևյալ օրինակից. Նոսր գազում բարձր ջերմաստիճանների դեպքում յուրաքանչյուր մոլեկուլի զանգվածգծային չափերը շատ փոքր էեն մոլեկուլների միջև բնութագրական հեռավորության համեմատ։ Թվում էրէ, թե կարելի է անտեսել մոլեկուլի զանգվածըչափերը և այն համարել նյութական կետ։ Սակայն դա ոչ միշտ է այդպես. մոլեկուլների տատանումները և պտույտները և մոլեկուլի ներքին էներգիայի կարևոր «պահեստ» էեն, որի «տարողությունը» որոշվում է մոլեկուլի չափերով, կառուցվածքով ու քիմիական հատկություններով։ Լավ մոտավորությամբ նյութական կետ կարելի է երբեմն համարել միատոմ մոլեկուլը ([[իներտ գազեր]]), [[մետաղ]]ների գոլորշիները և այլն, սակայն նույնիսկ նման մոլեկուլների մոտ բավականաչափ բարձր ջերմաստիճաններում դիտվում են էլեկտրոնային թաղանթների գրգռումներ։
