ԴՆԹ լիգազ
ԴՆԹ լիգազ (ՖՀ 6.5.1.1), ֆերմենտ, լիգազ, որը կատալիզում է ԴՆԹ-ի շղթաների միացումը՝ ֆոսֆոդիէսթերային կապերի առաջացմամբ[1]։
| ԴՆԹ լիգազ | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Քրոմոսոմալ վնասվածքը կարգավորող ԴՆԹ լիգազ | |||||||||
| Տեսակ | group or class of enzymes? | ||||||||
| Ենթադաս | Լիգազներ և DNA-modifying enzyme? | ||||||||
| Բնորոշիչներ | |||||||||
| ՖՀ համար | |||||||||
| CAS համար | |||||||||
| Տվյալներ | |||||||||
| IntEnz | |||||||||
| BRENDA | |||||||||
| ExPASy | |||||||||
| KEGG | |||||||||
| MetaCyc | |||||||||
| PRIAM | |||||||||
| Protein Data Bank | |||||||||
| Գենի օնտոլոգիա | |||||||||
| |||||||||
| Լիգազ I, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ | |
|---|---|
 | |
| Բնորոշիչներ | |
| Սիմվոլ | LIG1 |
| Entrez | |
| HUGO | |
| OMIM | |
| RefSeq | |
| UniProt | |
| Այլ տվյալներ | |
| Լոկուս | Քրոմ. 19 |
| Լիգազ III, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ | |
|---|---|
| Բնորոշիչներ | |
| Սիմվոլ | LIG3 |
| Entrez | |
| HUGO | |
| OMIM | |
| RefSeq | |
| UniProt | |
| Այլ տվյալներ | |
| Լոկուս | Քրոմ. 17 |
| Լիգազ IV, ԴՆԹ, ԱԵՖ-կախյալ | |
|---|---|
| Բնորոշիչներ | |
| Սիմվոլ | LIG4 |
| Entrez | |
| HUGO | |
| OMIM | |
| RefSeq | |
| UniProt | |
| Այլ տվյալներ | |
| Լոկուս | Քրոմ. 13 |
ԴՆԹ լիգազը օգտագործվում է ԴՆԹ ռեպարացիայի և ռեպլիկացիայի ժամանակ։ Բացի այդ՝ այն օգտագործվում է մոլեկուլային կենսաբանության մեջ, ռեկոմբինանտ ԴՆԹ-ի ստացման համար։
Առաջին անգամ ԴՆԹ լիգազ ստացվել և նկարագրվել է 1967 թվականին[2]։
ՄեխանիզմԽմբագրել
ԴՆԹ լիգազի ազդման մեխանիզմն իր մեջ է ներառում երկու ֆոսֆոդիէսթերային կապերի առաջացումը նուկլեոտիդներից մեկի 3' հիդրօքսիլի և մյուսի 5' ֆոսֆատի միջև։ ԱԵՖ-ն անհրածեշտ է հետևյալ երեք պրոցեսներում
- ֆերմենտի ակտիվ կենտրոնում լիզինի մնացորդի ադենիլացում
- ԱՄՖ-ի փոխանցում 5' ֆոսֆատի մոտ
- ֆոսֆոդիէսթերային կապի առաջացում[3]
ՏեսակներԽմբագրել
E. coli ԴՆԹ լիգազԽմբագրել
E. coli ԴՆԹ լիգազը կոդավորվում է lig գենով։ Շատ պրոկարիոտների մոտ ԴՆԹ լիգազը ստանում է էներգիա NAD-ից[4]։
T4 ԴՆԹ լիգազԽմբագրել
Բակտերիոֆագ T4-ից ստացված ԴՆԹ լիգազը հաճախ օգտագործվում է կենսաբանական լաբորատորիաներում[5][6]։
Կաթնասունների լիգազներԽմբագրել
Կաթնասունների մոտ կան հիմնականում չորս տիպի լիգազներ[4]՝LIG1, LIG2, LIG3, LIG4։
Տես նաևԽմբագրել
ԾանոթագրություններԽմբագրել
- ↑ Pascal JM, O'Brien PJ, Tomkinson AE, Ellenberger T (November 2004)։ «Human DNA ligase I completely encircles and partially unwinds nicked DNA»։ Nature 432 (7016): 473–8։ PMID 15565146։ doi:10.1038/nature03082
- ↑ Weiss B, Richardson CC (April 1967)։ «Enzymatic breakage and joining of deoxyribonucleic acid, I. Repair of single-strand breaks in DNA by an enzyme system from Escherichia coli infected with T4 bacteriophage»։ Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 57 (4): 1021–8։ PMC 224649։ PMID 5340583։ doi:10.1073/pnas.57.4.1021
- ↑ Lehman IR (November 1974)։ «DNA ligase: structure, mechanism, and function»։ Science 186 (4166): 790–7։ PMID 4377758։ doi:10.1126/science.186.4166.790
- ↑ 4,0 4,1 Foster JB, Slonczewski J (2010)։ Microbiology: An Evolving Science (Second ed.)։ New York: W. W. Norton & Company։ ISBN 0-393-93447-0
- ↑ «Ligases»։ Enzyme Resources Guide։ Promega Corporation։ էջեր 8–14
- ↑ Wilson RH, Morton SK, Deiderick H, Gerth ML, Paul HA, Gerber I, Patel A, Ellington AD, Hunicke-Smith SP, Patrick WM (July 2013)։ «Engineered DNA ligases with improved activities in vitro»։ Protein Eng. Des. Sel. 26 (7): 471–8։ PMID 23754529։ doi:10.1093/protein/gzt024
Արտաքին հղումներԽմբագրել
- ԴՆԹ լիգազ՝ PDB-ի ամսվա մոլեկուլ Archived 2009-01-20 at the Wayback Machine.
- Ընդհանուր տեղեկություններ
- ԴՆԹ լիգազայի մեխանիզմ