Մասնակից:Զոյա Գրիգորյան/Ավազարկղ1

ՌՆԹ-ների սեքվենավորում, ՌՆԹ-ի առաջնային կառուցվածքի որոշում:Այս հասկացության տակ կարող ենք հասկանալ ինչպես մատրիցային ՌՆԹ-ների, անպես էլ չկոդավորող ՌՆԹ-ների նուկլեոտիդային հաջորդականության որոշումը: ՌՆԹ-ների ժամանակակից սեքվենավորումը (RNA-seq) հիմնված է կոդավորող ԴՆԹ-ի, հատվածի ուղղակի սեքվենավորման վրա :

== Պատմություն==

Սեքվենսների գրադարանի ստեղծման գործընթացը կարող է փոփոխվել ,կապված բարձրարդյունավետ սեքվենսավորման հարթակից:Ամեն հարթակի համար մշակվել են մի քանի համալիր հավաքածուներ,ՌՆԹ-ների տարբեր տիպի գրադարաններ ստեղծելու համար,որոնց ՌՆԹ-ների հաջորդականությունները հարմարեցվում են որոշակի տեխնոլոգիաների յուրահատուկ պահանջներին:Սակայն վերլուծվող օրինակի բնույթից կախված,ամեն տեխնոլոգիայի շրջանակներում կան ընդհանուր գծեր:Հաճախ մ-ՌՆԹ-ի/մատրիցայինՌՆԹ,ի-ՌՆԹ/ վրա որևէ ազդեցություն պարզելու համար ,ՌՆԹ-ի վերջում դրվում է պոլի-А պոչ,որպեսզի համոզվենք կոդավորող և չկոդավորող ՌՆԹ-ների սահմանազատման մեջ:Դրան կարող ենք հասնել տվյալ տեղամասի հետ միասին՝ օլիգո T պրայմերի հասարակ այրմամբ:Այդ նպատակով այժմ,հաճախ օգտագործում են մագնիսական ուլունքներ:<<The Protokol onlajn>>վեբ սայթը ներկայացնում է ՌՆԹ-ի անջատմանը վերաբերվող մի քանի արձանագրություններ:

Պոլի -А ՌՆԹ-ների գրադարան

Արագ և լայնածավալ սեքվենավորման տեխնոլոգիական հիմքն սեղծվել է 2005 թվականին`454Life Sciences և IIIumina/ նախկինում Solexsa/ ընկերությունների կողմից,սկզբում օգտագործելով գենոմների սեքվենավորման համար:Տրանսկրիպտոմների /տրանսկրիպցիայի միջոցով ստացված նյութեր/ սեքվենավորման առաջին աշխատանքները հայտնվել են 2008 թվականին:Առաջին սեքվենավորվածների մեջ եղել են խմորասնկերի/դրոժներ/,արադոպսիսի և մկան տրանսկրիպտոմները: Այժմ որպես ՌՆԹ-ի լայնամասշտաբ սեքվենավորման գործիքային հարթակ օգտագործվում են IIIumina,454Life Sciences և SOLID միջոցները:Ի տարբերություն տրանսկրիպտոմի վերլուծության մեկ այլ լայնամասշտաբ կիրառվող մեթոդի՝ էքսպրեսիոն միկրոչիպերի,ՌՆԹ սեքվենավորումը հնարավորություն է տալիս տվյալներ ստանալ տրանսկրիպտոմների սպլայս տարբերակների,նուկլեոտիդային խմբագրումների,միանուկլեոտիդային պոլիմորֆիզմների/բազմաձևություննրի/,ինչպես նաև քիմերային գեների /химерные гены/ մասին:Բացի այդ ՌՆԹ-ների սիքվենավորումը հնարավորություն է տալիս ստանալ քանակական բացարձակ տեղեկություններ փորձանմուշի տրանսկրիպտոմների մասին,ի տարբերություն միկրոչիպերի հարաբերական քանակական տվյալների:

Ծանոթություն ↑ Haas BJ, Zody MC. Advancing RNA-Seq analysis. Nat Biotechnol. 2010 May;28(5):421-3. doi: 10.1038/nbt0510-421. ↑ Margulies M et al Genome sequencing in microfabricated high-density picolitre reactors. 2005 Sep 15;437(7057):376-80. Epub 2005 Jul 31. ↑ Simon T Bennett, Colin Barnes, Anthony Cox, Lisa Davies, and Clive Brown Toward the $1000 human genome. Pharmacogenomics, Jun 2005, Vol. 6, No. 4 , Pages 373—382 ↑ Nagalakshmi U, Wang Z, Waern K, Shou C, Raha D, Gerstein M, Snyder M. The transcriptional landscape of the yeast genome defined by RNA sequencing. Science. 2008 Jun 6;320(5881):1344-9. doi: 10.1126/science.1158441. Epub 2008 May 1.